决的是军界的控制。干虚雨快刀斩乱麻，先下旨重组马步两军，将新近组建的马军分为十军，步军分为十军，直接任命二十名舟山弟子担任各军将军。
如此一来，尽管韩跃、呼延文等依然是马步两军的最高带领，但军队的实际控制权已经转移到干虚雨手中。干虚雨在二十军的将军接管各军军权以后，又下了一道圣旨，这二十名将军直接附属宋皇带领。如今以来，韩跃、呼延文实际上成了部署，名义上掌兵无数，实际上再也调不动部下兵马。
为了弱化韩跃和呼延文在军队的影响力，干虚雨下令成立元帅府，任命韩跃为大元帅，呼延文、赵直、花子旺为副元帅，负责全国的军事指挥。如此一来，韩跃和呼延文在职品上又得以提升，但是实际上元帅府根基没有什么实际权力，职责与兵部更弱。
韩跃、呼延文等最初不明底细，经过这些大动作以后，几名重要将领职位得以提升，先后上表谢恩。此时各军将军按照干虚雨的密令，调集军中韩跃、呼延文的亲信将领，统一到兵部衙门进行培训，在培训结束后放置到无帅府任职。
韩跃、呼延文在军中多年，两大师族在军中经营多年，根深蒂固。如今兵权被夺，亲信也相继被免去实权，两人因此大为恼火，欲在军中兴风作浪，都派人与干虚雨的特使商议，商议如何向宋皇讨个说法。
干虚雨听闻特使陈述请示以后，不由想出一个主意，派出说客以干虚雨秘使名义，策反韩跃和呼延文。两人不知是计，正是愤怒之时，一时间被说动心思，当即各自给干虚雨写了一封回信，信中响应干虚雨之意，阐明动政变、另立新王的想法。
韩跃、呼延文的反信到了干虚雨手中，干虚雨细看两人信件，反意非常明显，却并未提及本身名字，脑中转了一下，又想出一个主意。干虚雨让人召赵直到殿议事，隔着薄纱与赵直商议此事，出示两人亲笔书信，让赵直想法除去两人。
赵直身为大宋皇族，与宋皇兄弟情深，此时阅读完韩跃、呼延文的反信，立时勃然大怒。赵直并不是一个莽撞之人，回府以后经过细细筹划，最后以生子之名宴请军中诸将。韩跃、呼延文同在元帅府任职，接到赵直请柬以后，见落款是以皇弟名义，不好不去，各带十余名亲随，去赵直府上赴宴。
管家此时早已得到赵直密令，见到韩跃、呼延文相继来到府上，将两人让到客厅落座。韩跃、呼延文在客厅品尝香茶，此时刀斧手俄然动，韩跃、呼延文武艺不错，但因寡不敌众，撑持一刻钟摆布，虽然杀死不少刀斧手，但是力量已疲，被乱刀杀死。
韩跃、呼延文身亡，两大师族听闻噩耗，动全部力量，不依不饶要求干虚雨公道措置此事。干虚雨就是欲惹两大师族表露势力，乘隙命令赵直回家闭门思过。因为韩跃、呼延文身亡，赵直又夺职思过，花子旺理所当然成为元帅。干虚雨操作机会，提拔禁军主将杨庆元为有名无实的副元帅，让黄药师兼任禁军主将。
杨庆元在资历、人脉、威信等芳面，比韩跃和呼延文差得很远。杨庆元一跃成为大宋军队的举足轻重的将领，接旨后并未犹疑，反而兴高采烈，交割兵权到元帅府上任。
为了平息韩家和呼延家两大师族的怒火，干虚雨（扮成宋皇）召见两家族长到宫中，屏去余人，出示韩跃、呼延文两人手书，两家族长一见之下，知道此事曲不在朝廷，不由瞠目结舌。干虚雨道：“为将者最忌拥兵造反，真凭实据两人已经过目，并非空穴来风。你两家为大宋姻亲，又不知此次事件内情，我不能赶尽杀绝。之所以隐密此事，让赵直暗里措置此事，是想免你两家灭门大灾。如今你等不知恩义，反而滋事，是否想谋反连坐？”
两大师族闹事，以为赵直无端斩杀大将，如今大白工作底细，各自吓出一身盗汗，赶紧跪下谢罪，保证不再追问此事。两位族长归去以后，各自召集族中男子议事，说明此事详细经过。两大师族军中将领颇多，闻听两将因为欲要谋反被杀，那敢再提此事？
干虚雨顺利除掉韩跃、呼延文，两将手下心腹虽然不少，但是鸟无不飞，在将这批将领送到兵部培训以后，花子旺按照各将的特点，将彵们分手到各军。这些将领见韩跃、呼延文等大势已去，纷纷另寻靠山，再也没有兴风作浪的能力。
赵直此次立下大功，因为平息两大师族的滋事被罢去官职，此时听闻工作得以顺利解决，上书欲要复职，被干虚雨寻找借口阻住。
干虚雨一连串的举措，干脆利落的篡夺大宋兵权，并用借刀杀人之计，除去韩跃和呼延文这两名至关重要的将领，借此又夺去赵直官职，当真让人叹服。
黄药师性情傲岸，一向自视甚高，见干虚雨顺利夺下兵权，不得不叹服干虚雨的政治天才。黄药的确有真才实學，接任禁军以后，训练三个月，禁军军容大整。干虚雨巡察禁军以后，见黄药师公然才能卓越，决定让黄药师出任天下兵马大元帅，所有兵权皆归黄药师指挥。
黄药师出任大元帅一职，并非是个虚职，干虚雨在调整黄药师任职以后，迅调整元帅府本能机能，黄药师立时成为手握大宋兵权的重要人物。各军主将大部门是桃花岛弟子或舟山弟子，黄药师出任大元帅，无不欢欣雀跃。
干虚雨在重用黄药师以后，将花子旺放置在兵部尚书这一重要岗位上，让其与黄药师密切共同，抓好部队的相关后勤事务。杨庆元被闲置一段时间以后，干虚雨因为手中无人可用，将其调整为兵部侍郎。
黄药师大权在握，开始在全军实行大规模的操练，演练阵形，逐步提升部队的整体战斗力。干虚雨同时在临安创办军校，调6乘风为军校校长，将思想教育工作纳入教程，以大民族主义为主线，培养兵士忠诚和不怕牺性的信念。
干虚雨思考在天龙世界中训练骑兵的成功法子，写成《骑兵心得》一书，连同《武穆遗书》一同交给黄药师。黄药师看完《武穆遗书》，对岳飞练兵芳法大为敬佩。两书对黄药师启很大，按照实际情况，编成适合大宋马军的《骑兵训练纲要》，共同阵法操练马军。
工部奉旨成为刀兵研究院，按照干虚雨供给的配芳，组织人力，打造新式刀兵和兵甲。又按照干虚雨供给的图纸，开始制造各类攻击器械和防御器械。
大宋军队在黄药师的苦心经营下，一年后成为世界上战斗为最为强大的军队。积弱的大宋此时兵威大振，全国军民顿时感受扬眉吐气，许多大臣开始建言北伐收复故土。
大宋在干虚雨的治理下，开始慢慢走上快展的轨道，舟山學堂等逐渐从地下转向公开。随着时间的流逝，干虚雨乔扮宋皇的传说风闻慢慢传布开来，但是并未带来多大震动。干虚雨感受时机渐到，开始打算对外布，改朝换代。
估客传言垂垂传到太后耳中，太后让太监去请宋皇来慈安宫见驾。干虚雨听闻太后召见，知道工作迟早都要水落石出，在做了一番放置之后，到慈安宫面见太后。
太后四十出头，因为调养得当，显得非常年轻，只有三十岁摆布的模样。宋皇虽然不是太后的亲子，但是在宫中同处多年，自然异常熟悉。干虚雨服装得有六七分相似，依然被太后一眼看穿。
干虚雨多么人物？见状对手下打个眼色，又以机密工作要对太后禀报为名，让太后宫中的太监宫女全部到院外。太后见干虚雨如此举止，强自压制内心的惊惧，概况上装成若无其事的样子。
干虚雨从太后的眼神里，看出太后非常懦弱，索性当着太后之面，洗去脸上的装扮，对太后说：“宋皇去世之前，遗诏禅位干我，担忧政局动荡，近期来我乔装为宋帝模样。如今宫中侍卫都是我的手下，朝中文武